DNA
Komplex mit Netropsin
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Netropsin
C N O

DNA
CGCAATTGCG

Komplex

Netropsin ist ein natürlich vorkommendes Antibiotikum mit Antitumor- und antiviraler Wirkung. Es bindet in der monor groove an DNA an AT-reichen Stellen. Die Bindungsstärke nimmt in der Folge AATT > TAAT = TTAA = ATAT > TATA ab.
Die Stickstoffatome der Amidgruppen im Netropsin (blaue Kugeln) bilden Wasserstoffbrücken zu den Basen der DNA, wobei von einem Netropsin-N je zwei Brücken (zu den Basen beider DNA-Stränge) ausgehen . Von den endständigen Stickstoffatomen gehen je drei Wasserstoffbrücken aus .

Literatur: CM Nunn et al, Biochemistry 36 (1997) 4792-4799

Inhaltsverzeichnis

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9-97 - R Bergmann